Kuroi Mato mới bước vào trung học, và trong ngày đầu tiên, cô đã để mắt tới Takanashi Yomi – bạn cùng lớp với mình. Hai người họ gặp nhau. Một Mato hồn nhiên, ngây thơ và một Yomi chững chạc. Tuy có nhiều khác biệt nhưng họ đã nhanh chóng trở thành bạn thân. Vào năm thứ 2, họ bị xếp vào 2 lớp khác nhau, và bắt đầu xa cách. … Ở một thế giới khác, một cô gái trẻ có ánh mắt toát ra ngọn lửa màu xanh, Black Rock Shooter đang chiến đấu với một cô gái khác. người đang giữ một lưỡi hái đen, Dead Master, và trận chiến sinh tử bắt đầu.
